Von 1992 bis 1994 unterrichtete Pantillon am Schubert-Konservatorium in Wien, er war Solocellist der Wiener Kammerphilharmonie und Stimmführer im Orchester der Wiener Volksoper.

1995 debütierte er im Großen Musikvereinssaal als Solist in Beethovens Tripelkonzert mit Klara Flieder, Violine und Rico Gulda, Klavier. 1993-1998 war er Mitglied des Arcus Ensemble Wien (Klavierquintett) und des Ensemble Wien Tokyo (Streichsextett). Seit der Gründung des Aron Quartetts 1998 ist er Mitglied dieses Ensembles.

Im Rahmen seiner Lehrtätigkeit gibt Christophe Pantillon Meisterkurse für Cello und Kammermusik in Japan (Tokyo, Nagoya, Ueda), Chicago (North Eastern University), in der Schweiz (Jeunesses Musicales), Holland (Konservatorium Nijmegen), Frankreich, Griechenland, Spanien (Nationales Jugendorchester Jonde) und Österreich (Int. Meisterkurse Hartberg).

Seine rege Konzerttätigkeit als Solist und Kammermusiker führte zu Auftritten in Wien (Konzerthaus, Musikverein), Salzburg (Mozarteum), Zürich (Tonhalle), Tokyo (Casals Hall), Prag (Suk Hall), New York (Carnegie Hall), London, Paris, Moskau (Tschaikowsky-Konservatorium) u.a. sowie zu zahlreichen Festivals, wie Menuhin Festival Gstaad, Styriarte Graz, Wien modern, Intern. String Quartet Festival Prag, Mahler Fest Kassel, Aix-en-Musique, Festival International de la Roque-d'Anthéron, ''Flaneries Musicales'' de Rheims, Festival de l'Epeau, Mostly Music Chicago, Festival Musical de Santo Domingo.